Resumo A infecção por Neospora caninum é considerada uma das principais causas de aborto entre bovinos. Esta pesquisa foi realizada no município de Rolim de Moura, estado de Rondônia, Brasil. Um questionário que investiga os aspectos epidemiológicos da neosporose foi utilizado na análise dos fatores de risco associados à prevalência em animais e em rebanhos. Um total de 416 amostras de sangue bovino foi colhido em 30 fazendas, e os níveis de anticorpos de N. caninum foram mensurados pela reação de Imunofluorescência Indireta (RIFI). A análise das amostras mostrou prevalência de anticorpos contra N. caninum de 47,36% (n = 197). Os fatores de risco associados à infecção por N. caninum foram o sistema de manejo e os locais de acesso dos cães. Os resultados da presente pesquisa indicam que a infecção de bovinos leiteiros com N. caninum está disseminada na região estudada da Amazônia Ocidental, o que tem implicações para a prevenção e controle da neosporose nessa região. Portanto, estratégias e medidas de controle integrado são recomendadas para prevenir e controlar a infecção por N. caninum em gado leiteiro. Além disso, o contato íntimo entre gado leiteiro, cães e animais selvagens, pode influenciar a epidemiologia da neosporose e deve ser investigada mais detalhadamente.

Abstract Neospora caninum is considered to be one of the main causes of abortion among cattle. The present survey was conducted in the municipality of Rolim de Moura, Rondônia State, Brazil. A questionnaire that investigates the epidemiological aspects of neosporosis was used in the analysis of risk factors associated with the animal-level and herd-level prevalence in dairy cattle. A total of 416 bovine blood samples were collected from 30 farms, and N. caninum antibody levels were measured by Indirect Fluorescent Antibody Test (IFAT). Analysis of dairy cattle serum samples revealed the presence of anti-N. caninum antibodies to be 47.36% (n = 197). Risk factors associated with N. caninum infection were the management system and access locations of dogs. The results of the present survey indicated that infection of dairy cattle with N. caninum is widespread in the studied region of Western Amazon, which has implications for prevention and control of neosporosis in this region. Therefore, integrated control strategies and measures are recommended to prevent and control N. caninum infection in dairy cattle. In addition, direct contact between dairy cattle, dogs and wild animals, which can influence the epidemiology of neosporosis, should be investigated further.

Resumo Pequenos mamíferos não voadores (marsupiais e pequenos roedores) foram capturados em três diferentes períodos, ao longo de 23 fragmentos florestais de três municípios (Alta Floresta, Sinop e Cláudia), localizados no bioma amazônico do Estado de Mato Grosso, no centro-oeste do Brasil. Os tecidos dos animais (fígado e baço) e sangue foram selecionados e submetidos a ensaios moleculares para a detecção do DNA de Babesia, Coxiella, Cytauxzoon, Hepatozoon, Theileria e agentes Anaplasmataceae. Um total de 230 espécimes (78 roedores e 152 marsupiais) foram capturados. Hepatozoon e agentes Piroplasmorida foram detectados em gambás (Didelphis marsupialis). Ao contrário, todas as amostras (sangue, fígado ou baço) coletadas dos pequenos mamíferos foram negativas para o gênero Coxiella e a família Anaplasmataceae, conforme detectado pela reação em cadeia da polimerase (PCR). Análises filogenéticas inferidas pelas sequências parciais do gene 18S rRNA evidenciaram a ocorrência de novos haplótipos de Hepatozoon e Piroplasmorida. Futuros estudos determinando a importância do gambá-comun (D. marsupialis) nos ciclos epidemiológicos de Hepatozoon e Babesia em condições naturais, no bioma amazônico, são necessários.

Abstract Small non-volant mammals (marsupials and small rodents) were captured at three different timepoints from 23 forest fragments across three municipalities (Alta Floresta, Sinop and Cláudia) covering the Amazonian biome of the Mato Grosso State in Midwestern Brazil. The animal tissues (liver and spleen) and blood were screened using molecular tools for the detection of Babesia, Coxiella, Cytauxzoon, Hepatozoon, Theileria, and Anaplasmataceae agents. A total of 230 specimens (78 rodents and 152 marsupials) were trapped. Hepatozoon and Piroplasmorida agents were detected in the common opossums (Didelphis marsupialis). In turn, all samples (blood, liver, or spleen) collected from the small mammals were negative for the genus Coxiella and the family Anaplasmataceae, as detected by polymerase chain reaction (PCR). Phylogenetic analyses inferred from partial sequences of the 18S rRNA gene highlighted the occurrence of new Hepatozoon and Piroplasmorida haplotypes. Future studies determining the role of common opossum (D. marsupialis) in the epidemiological cycles of Hepatozoon and Babesia under natural conditions in the Amazonian biome are necessary.

Resumo Para estimar a soroprevalência de Toxoplasma gondii e Neospora caninum, utilizando a reação de imunofluorescência indireta (RIFI), e identificar os fatores de risco associados, foram coletadas amostras de soro de 1.070 suínos provenientes de 320 criatórios de fundo de quintal no Estado de Mato Grosso. A soroprevalência para nível animal de T. gondii e N. caninum foi de 32,48% e 13,49%, respectivamente, com uma soroprevalência de rebanho de 55,63% para T. gondii e 27,81% para N. caninum. Alimentar os animais com sobras aumenta a probabilidade da presença de anticorpos anti-T. gondii em porcos em 1,09 vezes. Ao contrário de T. gondii, a alimentação baseada em sobras foi encontrada como negativamente associada à soropositividade para N. caninum na análise em nível de fazenda e no modelo em nível animal, diminuindo assim as chances de positividade. Ainda, a idade foi considerada um fator de risco para a soropositividade para N. caninum. Mais estudos são necessários para avaliar o impacto da infecção por T. gondii na produção de suinocultura de quintal e sua importância como fonte de infecção para toxoplasmose em humanos no Estado de Mato Grosso, bem como o papel dos suínos domésticos na epidemiologia da neosporose.

Abstract To estimate the seroprevalence of Toxoplasma gondii and Neospora caninum, using an indirect immunofluorescent assay (IFA), and identify the risk factors associated, serum samples were collected from 1,070 pigs from 320 backyard pig farming in the of Mato Grosso state. The animal-level seroprevalence of T. gondii and N. caninum was 32.48% and 13.49%, respectively, with a herd seroprevalence of 55.63% for T. gondii and 27.81% for N. caninum. Feeding the animals with leftovers increases the probability of the presence of anti-T. gondii antibodies in pigs by 1.09-fold. Unlike to T. gondii, feeding with leftovers was found to be negatively associated with N. caninum seropositivity in farm-level analysis and in the animal-level model, so decreasing the chances of positivity. Yet, age was considered a risk factor for N. caninum seropositivity. Further studies are necessary to evaluate the impact of T. gondii infection on backyard pig farming production, and its importance as a source of toxoplasmosis infection in humans in the Mato Grosso state, as well as, the role of domestic pigs in the epidemiology of neosporosis.

Resumo Foi avaliada a distribuição de piroplasmídeos em equídeos do Estado de Mato Grosso, no Centro-Oeste do Brasil, utilizando-se métodos moleculares e a diversidade genética interespecífica. Para isso, 1.624 amostras de sangue de equídeos de 973 fazendas foram examinadas pela PCR, usando pares de oligonucleotídeos que amplificam um fragmento dos genes rap-1and ema-1 de Babesia caballi e Theileria equi, respectivamente. Para caracterização molecular e estudos filogenéticos, foram utilizadas 13 e 60 sequências dos genes rap-1 e ema-1, respectivamente, para construção de um dendograma utilizando máxima parcimônia. B. caballi e T . equi foram detectados em 4,11% e 28,16% das fazendas, respectivamente, e a prevalência molecular foi de 2,74% para B. caballi e 25,91% para T. equi. A localização das fazendas e animais criados na ecorregião do Pantanal influenciam a probabilidade de equídeos serem positivos para B. caballi e T. equi. Além disso, idade e propósito do rebanho foram variáveis, significativamente, associadas à infecção por T. equi. As sequências de B . caballi apresentaram variabilidade intraespecífica de 1,95%, contrastando com 2,99% em T. equi. Dendrogramas para ambas as espécies demonstraram a presença de subgrupos com altos valores de sustentação dos ramos. No entanto, não é possível associar esses grupos com origem geográfica e/ou ecorregião.

Abstract We evaluated the distribution of piroplasmids in equids from the Mato Grosso state in Midwestern Brazil using molecular methods and the interspecific genetic diversity. For this, 1,624 blood samples of equids from 973 farms were examined by PCR, using primer pairs that amplify a fragment of the genes rap-1 and ema-1 of Babesia caballi and Theileria equi, respectively. For molecular characterization and phylogenetic studies, 13 and 60 sequences of the rap-1 and ema-1 genes, respectively, were used to build a dendogram using maximum parsimony. B. caballi and T. equi were detected in 4.11% and 28.16% of the farms, respectively, and molecular prevalence was 2.74% for B. caballi and 25.91% for T. equi. The location of the farms and animals raised in the Pantanal ecoregion influence the probability of equids testing positive for B. caballi and T. equi . Moreover, age and herd purpose were variables significantly associated with T . equi infection. The sequences of B. caballi presented 1.95% intraspecific variability, contrasting with 2.99% in T. equi. Dendrograms for both species demonstrated the presence of subgroups with high values of support of branches. However, it is not possible to associate these groups with geographic origin and/or ecoregion.

Resumo Trypanosoma (Megatrypanum) theileri é um protozoário flagelado que infecta ruminantes e apresenta alta diversidade genética. Neste estudo, investigamos as taxas de prevalência deste protozoário com base na hemocultura e no diagnóstico molecular. Os isolados de T . theileri obtidos foram caracterizados pelos marcadores moleculares SSU rDNA e gGAPDH e o diagnóstico molecular foi baseado no gene do tipo Catepsina L (PCR-TthCATL). O PCR-TthCATL e a hemocultura indicaram uma taxa de prevalência total de 8,13% e a sequência derivada do gene Catepsina L denominada IB de T. theileri foi identificada pela primeira vez em bovinos da Amazônia Ocidental, bem como a IF no Brasil. Também descrevemos uma possível nova sequência derivada da PCR-TthCATL em bovinos, designada IL.

Abstract Trypanosoma (Megatrypanum) theileri is a flagellated protozoan that infects ruminants and it displays high genetic diversity. In this study, we investigated the prevalence rates of this protozoan based on hemoculture and molecular diagnosis. The isolates of T. theileri thus obtained were characterized by molecular markers SSU rDNA and gGAPDH and molecular diagnosis based on Cathepsin L-like gene (PCR-TthCATL). The PCR-TthCATL and hemoculture indicated an overall prevalence rate of 8.13%, and the CATL derived sequence named IB was identified for the first time in cattle in the western Amazon region, as well as IF in Brazil. We also describe a possible new PCR-TthCATL derived sequence in cattle, designated IL.

RESUMO: O município de Ji-Paraná, Rondônia, é uma das principais áreas de produção leiteira na região norte do Brasil. Assim, é importante avaliar agentes infecciosos que apresentam potencial para afetar negativamente a produtividade na indústria. O objetivo deste estudo foi investigar a prevalência de ' Candidatus Mycoplasma haemobos' usando um método de detecção baseado na PCR e relacionar com variáveis do rebanho leiteiro (frequência de aborto, nascimento de bezerros fracos, número total de vacas, número de vacas >24 meses de idade, tamanho da propriedade e, sistema de produção) na agricultura familiar do município de Ji-Paraná, região norte, Brasil. Amostras de sangue foram coletadas de 320 vacas leiteiras localizadas em 64 fazendas (ou seja, cinco animais por exploração) de setembro de 2012 a novembro de 2013. A prevalência total de ' Ca. M. haemobos' foi de 64,2% e a prevalência por rebanho foi de 95,3%; o número de vacas >24 meses de idade nas propriedades estudadas correlacionou-se com as taxas de infecção por ' Ca. M. haemobos'. Considerando a importância da indústria de laticínios para a área de estudo, investigações adicionais são necessárias para avaliar o efeito da infecção crônica nestes animais na produção de leite e saúde do rebanho.

ABSTRACT: The municipality of Ji-Paraná, Rondônia, is one of the major dairy production areas in the north region of Brazil. Thus, it is important to evaluate infectious agents that have the potential to negatively affect productivity in the industry. The objective of this study was to investigate the prevalence of ' Candidatus Mycoplasma haemobos' by using a PCR-based detection method and correlate this with dairy herd variables (abortion frequency, weak calf birth rate, total cattle number, >24-month-old cow number, farm size, and production system) in family farms of the Ji-Paraná municipality, north region, Brazil. Blood samples were collected from 320 dairy cows located across 64 farms (i.e., five animals per farm) from September 2012 to November 2013. Overall prevalence of 'Ca. M. haemobos' was 64.2% and prevalence per herd was 95.3%; the number of >24-month-old cows in the farms studied correlated with ' Ca. M. haemobos' infection rates. Considering the importance of the dairy industry to the study area, additional investigations are necessary to evaluate the effect of chronic infection in these animals on milk production and herd health.

O presente estudo avaliou a presença de DNA deEhrlichia spp. em 320 cães das áreas urbana e rural do município de Poconé, região do Pantanal de Mato Grosso, pela PCR visando o gene dsb. Os fatores de risco para a infecção em cães também foram avaliados. Quarenta e oito (15%, IC 95%: 11,4-19,5%) cães foram positivos, 25 (15,6%, IC 95%: 10,4-22,2%) da área urbana e 23 (14,37%, 95% CI: 9,3-20,8%) da área rural (P > 0,05). Sequências parciais de DNAs obtidos a partir de produtos da PCR de 18 amostras da área urbana e 16 da área rural foram 100% idênticas a E. canis do Brasil e EUA. Este estudo relata a primeira detecção molecular deE. canis em cães da região norte do Pantanal.

The present study evaluated the presence of EhrlichiaDNA in the blood samples of 320 dogs from the urban and rural areas of the municipality of Poconé, Pantanal region, Mato Grosso state, by Polymerase Chain Reaction (PCR), targeting the ehrlichial dsbgene. Risk factors for infection in dogs were also evaluated. Forty-eight (15%, 95% CI: 11.4-19.5%) dogs were positive: 25 (15.6%, 95% CI: 10.4-22.2%) from the urban area and 23 (14.4%, 95% CI: 9.3-20.8%) from the rural area (P > 0.05). Partial DNA sequence obtained from PCR products of 18 samples from the urban area and 16 samples from the rural area were 100% identical to E. canis from Brazil and the USA. This study reports the first E. canis molecular detection in dogs from the northern Pantanal region.